Действие аниме «Полифоника» происходит в мире, где люди и духи живут в гармонии, объединённые магией музыки. Лишь избранные, называемые дэнтистами, способны исполнять божественные мелодии, связывающие два мира. Главный герой, Форон Татара, поступает в Академию Божественной Музыки, где начинает постигать тайны этого искусства. Его путь переплетается с судьбой Кортикарте, и вместе они учатся понимать не только музыку, но и друг друга.
Однако даже в этом, казалось бы, идеальном мире не всё спокойно. Террористические группировки сеют хаос, атакуя города и нарушая хрупкое равновесие между людьми и духами. Их действия угрожают не только мирному сосуществованию, но и самой основе этого мира — музыке. Форону и его друзьям предстоит столкнуться с опасностью, которая заставит их пересмотреть свои взгляды и закалить характер.
История рассказывает не только о приключениях и битвах, но и о взрослении, дружбе и поиске своего места в мире. Через музыку герои учатся слышать не только ноты, но и сердца окружающих. Их путь полон испытаний, но именно они делают их сильнее и помогают раскрыть истинную силу гармонии, способной изменить судьбу целого континента.